拟合线性混合效应模型gydF4y2Ba
返回线性混合效果模型,由gydF4y2Balme三个月gydF4y2Ba
= fitlme (gydF4y2Ba资源描述gydF4y2Ba
,gydF4y2Ba公式gydF4y2Ba
)gydF4y2Ba公式gydF4y2Ba
,拟合到表或数据集数组中的变量gydF4y2Ba资源描述gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
返回带有一个或多个指定的附加选项的线性混合效果模型gydF4y2Balme三个月gydF4y2Ba
= fitlme (gydF4y2Ba资源描述gydF4y2Ba
,gydF4y2Ba公式gydF4y2Ba
,gydF4y2Ba名称,值gydF4y2Ba
)gydF4y2Ba名称,值gydF4y2Ba
对参数。gydF4y2Ba
例如,您可以指定随机效应项的协方差模式、用于估计参数的方法或优化算法的选项。gydF4y2Ba
加载样例数据。gydF4y2Ba
负载gydF4y2Ba进口- 85gydF4y2Ba
将变量存储在表中。gydF4y2Ba
tbl = table(X(:,12),X(:,14),X(:,24),gydF4y2Ba“VariableNames”gydF4y2Ba, {gydF4y2Ba“马力”gydF4y2Ba,gydF4y2Ba“CityMPG”gydF4y2Ba,gydF4y2Ba“EngineType”gydF4y2Ba});gydF4y2Ba
显示表的前五行。gydF4y2Ba
台(1:5,:)gydF4y2Ba
ans =gydF4y2Ba5×3表gydF4y2Ba马力CityMPG引擎类型__________ _______ __________ 111 21 13 111 21 13 154 19 37 102 24 35 115 18 35gydF4y2Ba
拟合城市中每加仑汽油行驶英里数的线性混合效应模型,其中马力有固定效应,截距和按发动机类型分组的马力有不相关随机效应。gydF4y2Ba
Lme = fitlme(tbl,gydF4y2Ba“CityMPG ~马力+ (1 | EngineType) + (Horsepower-1 | EngineType)”gydF4y2Ba);gydF4y2Ba
在这个模型中,gydF4y2BaCityMPGgydF4y2Ba
是响应变量,马力是预测变量,发动机类型是分组变量。模型的固定效应部分对应于gydF4y2Ba1 +马力gydF4y2Ba
,因为默认情况下包括截取。gydF4y2Ba
由于截距和马力的随机效应项是不相关的,这些项是单独指定的。因为第二个随机效应项只适用于马力,所以必须包含gydF4y2Ba1gydF4y2Ba
消除第二个随机效应项的截距。gydF4y2Ba
显示模型。gydF4y2Ba
lme三个月gydF4y2Ba
模型信息:观测数量203固定效应系数2随机效应系数14协方差参数3公式:CityMPG ~ 1 +马力+ (1 | EngineType) +(马力| EngineType)模型拟合统计量:AIC BIC log似然偏差1099.5 1116 -544.73 1089.5固定效应系数(95% ci):名称估计SE tStat DF pValue{'(截取)'}37.276 2.8556 13.054 201 1.3147e-28{'马力'}-0.12631 0.02284 -5.53 201 9.8848e-08下上31.645 42.906 -0.17134 -0.081269随机效应协方差参数(95% ci):组:引擎类型(7级)Name1 Name2类型估计{'(截取)'}{'(截取)'}{'std'} 5.7338下上2.3773 13.829组:引擎类型(7级)Name1 Name2类型估计{'马力'}{'马力'}{'std'} 0.050357下上0.02307 0.10992组:错误名称估计下上{'Res Std'} 3.226 2.9078 3.5789gydF4y2Ba
请注意,截距和马力的随机效应协方差参数在显示中是分开的。gydF4y2Ba
现在,为城市中每加仑汽油行驶的英里数拟合一个线性混合效应模型,使用相同的固定效应项和潜在相关的随机效应,以发动机类型分组截距和马力。gydF4y2Ba
Lme2 = fitlme(tbl,gydF4y2Ba“CityMPG ~马力+(马力| EngineType)”gydF4y2Ba);gydF4y2Ba
因为随机效应项默认包含截距,所以不需要添加gydF4y2Ba1gydF4y2Ba
,随机效应项等于gydF4y2Ba(1 +马力|引擎类型)gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
显示模型。gydF4y2Ba
lme2gydF4y2Ba
模型信息:观测数量203固定效应系数2随机效应系数14协方差参数4公式:CityMPG ~ 1 +马力+(1 +马力|引擎类型)模型拟合统计量:AIC BIC log似然偏差1089 1108.9 -538.52 1077固定效应系数(95% ci):名称估计SE tStat DF pValue{'(截距)'}33.824 4.0181 8.4178 201 7.1678e-15{'马力'}-0.1087 0.032912 -3.3029 201 0.0011328上下25.901 41.747 -0.1736 -0.043806随机效应协方差参数(95% ci):EngineType(7个级别)Name1 Name2类型估计{'(拦截)'}{'(拦截)'}{'std'} 9.4952{'马力'}{'(拦截)'}{'corr'} -0.96843{'马力'}{'马力'}{'std'} 0.078874下上4.7022 19.174 -0.99568 -0.78738 0.039917 0.15585组:错误名称估计下上{'Res std'} 3.1845 2.8774 3.5243gydF4y2Ba
请注意,截距和马力的随机效应协方差参数在显示中是一起的,它包括相关性(gydF4y2Ba“相关系数”gydF4y2Ba
)在截距和马力之间。gydF4y2Ba
加载样例数据。gydF4y2Ba
负载gydF4y2Ba流感gydF4y2Ba
的gydF4y2Ba流感gydF4y2Ba
数据集数组有一个gydF4y2Ba日期gydF4y2Ba
变量,以及包含估计流感发病率的10个变量(在9个不同地区,根据谷歌®搜索估计,加上疾病控制和预防中心的全国估计)。gydF4y2Ba
要拟合线性混合效果模型,您的数据必须在正确格式化的数据集数组中。要拟合以流感率作为响应的线性混合效应模型,请将对应于区域的九列组合成一个数组。新的数据集数组,gydF4y2Baflu2gydF4y2Ba
,必须有新的响应变量gydF4y2BaFluRategydF4y2Ba
,名义变量gydF4y2Ba地区gydF4y2Ba
这显示了每个估计来自哪个地区,全国范围内的估计gydF4y2BaWtdILIgydF4y2Ba
,和分组变量gydF4y2Ba日期gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
Flu2 = stack(流感,2:10,gydF4y2Ba“NewDataVarName”gydF4y2Ba,gydF4y2Ba“FluRate”gydF4y2Ba,gydF4y2Ba...gydF4y2Ba“IndVarName”gydF4y2Ba,gydF4y2Ba“地区”gydF4y2Ba);flu2。日期=no米在al(flu2.Date);
的前六行显示gydF4y2Baflu2gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
flu2 (1:6,:)gydF4y2Ba
ans =日期WtdILI区域波动10/9/2005 1.182 NE 0.97 10/9/2005 1.182 MidAtl 1.025 10/9/2005 1.182 central1.232 10/9/2005 1.182 WNCentral 1.286 10/9/2005 1.182 SAtl 1.082 10/9/2005 1.182 ESCentral 1.457gydF4y2Ba
为全国范围内的估计拟合线性混合效应模型和固定效应项,gydF4y2BaWtdILIgydF4y2Ba
的随机截距gydF4y2Ba日期gydF4y2Ba
.该模型对应于gydF4y2Ba
在哪里gydF4y2Ba
就是观察gydF4y2Ba
的水平gydF4y2Ba
变量分组gydF4y2Ba日期gydF4y2Ba
,gydF4y2Ba
是随机效果的水平gydF4y2Ba
分组变量的gydF4y2Ba日期gydF4y2Ba
,gydF4y2Ba
观测误差是观测误差吗gydF4y2Ba
.随机效应具有先验分布,gydF4y2Ba
误差项有分布,gydF4y2Ba
Lme = fitlme(flu2,gydF4y2Ba' flate ~ 1 + WtdILI + (1|Date)'gydF4y2Ba)gydF4y2Ba
模型信息:观测数量468固定效应系数2随机效应系数52协方差参数2公式:波动~ 1 + WtdILI +(1 |日期)模型拟合统计量:AIC BIC log似然偏差286.24 302.83 -139.12 278.24固定效应系数(95% ci):名称估计SE tStat DF pValue{'(截取)'}0.16385 0.057525 2.8484 466 0.0045885 {'WtdILI'} 0.7236 0.032219 22.459 466 3.0502e-76下上0.050813 0.27689 0.66028 0.78691随机效应协方差参数(95% ci):组:日期(52级)Name1 Name2类型估计{'(截取)'}{'(截取)'}{'std'} 0.17146下上0.13227 0.22226组:错误名称估计下上{'Res std'} 0.30201 0.28217 0.32324gydF4y2Ba
估计的协方差参数显示在标题为“随机效应协方差参数”的部分。的估算值gydF4y2Ba
为0.17146,其95%置信区间为[0.13227,0.22226]。由于这个区间不包括0,随机效应项是显著的。的似然比检验可以正式检验任意随机效应项的显著性gydF4y2Ba比较gydF4y2Ba
方法。gydF4y2Ba
一个观测值的估计响应是固定效应和与该观测值相对应的分组变量水平上的随机效应值的和。例如,观察28的估计流感率为gydF4y2Ba
在哪里gydF4y2Ba 为截距随机效应的估计最佳线性无偏预测器(BLUP)。可以按如下方式计算该值。gydF4y2Ba
beta = fixedEffects(lme);[~,~,STATS] = randomEffects(lme);gydF4y2Ba计算随机效应统计数据(STATS)gydF4y2Ba统计数据。level = nominal(STATS.Level); y_hat = beta(1) + beta(2)*flu2.WtdILI(28) + STATS.Estimate(STATS.Level==“10/30/2005”gydF4y2Ba)gydF4y2Ba
Y_hat = 1.4674gydF4y2Ba
属性可以显示拟合的值gydF4y2Ba安装gydF4y2Ba
方法。gydF4y2Ba
F = fitting (lme);F (28)gydF4y2Ba
Ans = 1.4674gydF4y2Ba
加载样例数据。gydF4y2Ba
负载(gydF4y2Ba“shift.mat”gydF4y2Ba)gydF4y2Ba
数据显示了五名操作员在上午、晚上和晚上三班倒期间生产的产品与目标质量特征的绝对偏差。s manbetx 845这是一个随机块设计,其中的操作符就是块。本实验旨在研究换挡时间对性能的影响。绩效衡量是指质量特征与目标值的绝对偏差。这是模拟数据。gydF4y2Ba
拟合线性混合效应模型与随机截距分组的操作员,以评估性能是否显著不同,根据轮班的时间。使用限制性极大似然法和gydF4y2Ba“影响”gydF4y2Ba
对比。gydF4y2Ba
“影响”gydF4y2Ba
对比意味着系数和为0,并且gydF4y2BafitlmegydF4y2Ba
创建一个名为a的矩阵gydF4y2Ba固定效果设计矩阵gydF4y2Ba来描述位移的影响。这个矩阵有两列,gydF4y2Ba
而且gydF4y2Ba
,在那里gydF4y2Ba
该模型对应于gydF4y2Ba
在哪里gydF4y2Ba 表示观测值,和gydF4y2Ba 表示运算符,gydF4y2Ba = 1, 2,…, 15,和gydF4y2Ba = 1, 2,…5。随机效应和观测误差具有如下分布:gydF4y2Ba
而且gydF4y2Ba
Lme = fitlme(移位,gydF4y2Ba'QCDev ~ Shift + (1|Operator)'gydF4y2Ba,gydF4y2Ba...gydF4y2Ba“FitMethod”gydF4y2Ba,gydF4y2Ba“REML”gydF4y2Ba,gydF4y2Ba“DummyVarCoding”gydF4y2Ba,gydF4y2Ba“影响”gydF4y2Ba)gydF4y2Ba
模型信息:观测数15固定效应系数3随机效应系数5协方差参数2公式:QCDev ~ 1 + Shift +(1 |算子)模型拟合统计量:AIC BIC log似然偏差58.913 61.337 -24.456 48.913固定效应系数(95% ci):名称估计SE tStat DF pValue{'(拦截)'}3.6525 0.94109 3.8812 12 0.0021832 {'Shift_Evening'} -0.53293 0.31206 -1.7078 12 0.11339 {'Shift_Morning'} -0.91973 0.31206 -2.9473 12 0.012206下上1.6021 5.703 -1.2129 0.14699 -1.5997 -0.23981随机效应协方差参数(95% ci):组:操作符(5级)Name1 Name2类型估计{'(拦截)'}{'(拦截)'}{'std'} 2.0457下上0.98207 4.2612组:错误名称估计下上{'Res std'} 0.85462 0.52357 1.395gydF4y2Ba
计算随机效应的最佳线性无偏预测器(BLUP)估计。gydF4y2Ba
B = randomEffects(lme)gydF4y2Ba
B =gydF4y2Ba5×1gydF4y2Ba0.5775 1.1757 -2.1715 2.3655 -1.9472gydF4y2Ba
夜班工作的第三个操作员与目标质量特征的估计绝对偏差为gydF4y2Ba
您还可以按如下方式显示此值。gydF4y2Ba
F = fitting (lme);F(转变。转变= =gydF4y2Ba“晚上”gydF4y2Ba&转变。操作符==gydF4y2Ba“3”gydF4y2Ba)gydF4y2Ba
Ans = 0.9481gydF4y2Ba
类似地,您可以计算出第三个早班操作员与目标质量特征的估计绝对偏差为gydF4y2Ba
您还可以按如下方式显示此值。gydF4y2Ba
F(转变。转变= =gydF4y2Ba“早晨”gydF4y2Ba&转变。操作符==gydF4y2Ba“3”gydF4y2Ba)gydF4y2Ba
Ans = 0.5613gydF4y2Ba
在早班期间,操作员往往会犯较小幅度的错误。gydF4y2Ba
加载样例数据。gydF4y2Ba
负载(gydF4y2Ba“fertilizer.mat”gydF4y2Ba)gydF4y2Ba
数据集数组包括来自裂区实验的数据,其中土壤根据土壤类型分为三个块:沙质、粉质和壤土。每个地块被划分为五个地块,其中五种番茄植物(樱桃、传家宝、葡萄、藤蔓和李子)被随机分配到这些地块。然后将地块中的番茄植物划分为子地块,每个子地块使用四种肥料中的一种进行处理。这是模拟数据。gydF4y2Ba
将数据存储在名为gydF4y2BadsgydF4y2Ba
,并定义gydF4y2Ba番茄gydF4y2Ba
,gydF4y2Ba土壤gydF4y2Ba
,gydF4y2Ba肥料gydF4y2Ba
作为分类变量。gydF4y2Ba
Ds =肥料;ds。To米ato = nominal(ds.Tomato); ds.Soil = nominal(ds.Soil); ds.Fertilizer = nominal(ds.Fertilizer);
拟合线性混合效应模型,其中gydF4y2Ba肥料gydF4y2Ba
而且gydF4y2Ba番茄gydF4y2Ba
为固定效应变量,平均产量独立地随块(土壤类型)和块内地块(土壤类型中的番茄类型)而变化。gydF4y2Ba
这个模型对应于gydF4y2Ba
在哪里gydF4y2Ba = 1, 2,…, 60,指数gydF4y2Ba 与肥料类型相对应,gydF4y2Ba 对应番茄的种类,和gydF4y2Ba = 1,2,3对应块体(土)。gydF4y2Ba 代表了gydF4y2Ba 土壤类型,和gydF4y2Ba 代表了gydF4y2Ba 的番茄类型嵌套gydF4y2Ba 土壤类型。gydF4y2Ba 虚拟变量是否代表水平gydF4y2Ba 肥料。同样的,gydF4y2Ba 虚拟变量是否代表水平gydF4y2Ba 番茄的那种。gydF4y2Ba
随机效应和观测误差具有以下先验分布:gydF4y2Ba ~ N (0,gydF4y2Ba ),gydF4y2Ba ~ N (0,gydF4y2Ba ),gydF4y2Ba ~ N (0,gydF4y2Ba ).gydF4y2Ba
Lme = fitlme(ds,gydF4y2Ba产量~肥料*番茄+(1|土壤)+(1|土壤:番茄)gydF4y2Ba)gydF4y2Ba
模型信息:观测量60固定效应系数20随机效应系数18协方差参数3公式:产量~ 1 +番茄*肥料+(1 |土壤)+(1 |土壤:番茄)模型拟合统计量:AIC BIC log似然偏差522.57 570.74 -238.29 476.57固定效应系数(95% ci):名字估计SE tStat DF{(拦截)的}{‘Tomato_Grape} 77 8.5836 8.9706 -16 11.966 - -1.3371 40{‘Tomato_Heirloom} -6.6667 11.966 -0.55714 40{‘Tomato_Plum}{‘Tomato_Vine} 32.333 11.966 2.7022 -13 11.966 - -1.0864 40{‘Fertilizer_2} 40{‘Fertilizer_3} 33.667 34.667 8.572 4.0442 8.572 - 3.9275 40{‘Fertilizer_4} 47.667 8.572 5.5607 40{‘Tomato_Grape: Fertilizer_2} -2.6667 12.123 -0.21997 40{‘Tomato_Heirloom: Fertilizer_2} 8 12.123 - -0.65992 -15{“Tomato_Plum: Fertilizer_2”}12.123.-1.23.7440{'Tomato_Vine:Fertilizer_2' } -16 12.123 -1.3198 40 {'Tomato_Grape:Fertilizer_3' } 16.667 12.123 1.3748 40 {'Tomato_Heirloom:Fertilizer_3'} 3.3333 12.123 0.27497 40 {'Tomato_Plum:Fertilizer_3' } 3.6667 12.123 0.30246 40 {'Tomato_Vine:Fertilizer_3' } 3 12.123 0.24747 40 {'Tomato_Grape:Fertilizer_4' } 13.333 12.123 1.0999 40 {'Tomato_Heirloom:Fertilizer_4'} -19 12.123 -1.5673 40 {'Tomato_Plum:Fertilizer_4' } -2.6667 12.123 -0.21997 40 {'Tomato_Vine:Fertilizer_4' } 8.6667 12.123 0.71492 40 pValue Lower Upper 4.0206e-11 59.652 94.348 0.18873 -40.184 8.1837 0.58053 -30.85 17.517 0.010059 8.1496 56.517 0.28379 -37.184 11.184 0.00023272 17.342 51.991 0.00033057 16.342 50.991 1.9567e-06 30.342 64.991 0.82701 -27.167 21.834 0.51309 -32.501 16.501 0.22317 -39.501 9.5007 0.19439 -40.501 8.5007 0.17683 -7.8341 41.167 0.78476 -21.167 27.834 0.76387 -20.834 28.167 0.80581 -21.501 27.501 0.27796 -11.167 37.834 0.12492 -43.501 5.5007 0.82701 -27.167 21.834 0.47881 -15.834 33.167 Random effects covariance parameters (95% CIs): Group: Soil (3 Levels) Name1 Name2 Type Estimate {'(Intercept)'} {'(Intercept)'} {'std'} 2.5028 Lower Upper 0.027711 226.05 Group: Soil:Tomato (15 Levels) Name1 Name2 Type Estimate {'(Intercept)'} {'(Intercept)'} {'std'} 10.225 Lower Upper 6.1497 17.001 Group: Error Name Estimate Lower Upper {'Res Std'} 10.499 8.5389 12.908
的gydF4y2Ba
-固定效应系数显示中后12行对应的值(0.82701 ~ 0.47881)表明番茄与肥料类型间的互作系数不显著。为了测试番茄和肥料之间的整体相互作用,使用gydF4y2Ba方差分析gydF4y2Ba
方法采用改装后的模型gydF4y2Ba“影响”gydF4y2Ba
对比。gydF4y2Ba
随机效应项的标准差的置信区间(gydF4y2Ba ),其中截距按土壤分组,非常大。这一项似乎不重要。gydF4y2Ba
在移除交互项后改装模型gydF4y2Ba番茄:肥料gydF4y2Ba
还有随机效应gydF4y2Ba(1 |土壤)gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
Lme = fitlme(ds,gydF4y2Ba‘产量~肥料+番茄+(1|土壤:番茄)’gydF4y2Ba)gydF4y2Ba
模型信息:观测量60固定效应系数8随机效应系数15协方差参数2公式:产量~ 1 +番茄+肥料+(1 |土壤:番茄)模型拟合统计量:AIC BIC log似然偏差511.06 532 -245.53 491.06固定效应系数(95% ci):名字估计SE tStat DF{(拦截)的}77.733 7.3293 10.606 52{‘Tomato_Grape} -9.1667 9.6045 -0.95441 52{‘Tomato_Heirloom} -12.583 9.6045 -1.3102 52{‘Tomato_Plum} 28.833 9.6045 3.0021 52{‘Tomato_Vine} -14.083 9.6045 -1.4663 52{‘Fertilizer_2} 26.333 4.5004 5.8514 52{‘Fertilizer_3} 39 4.5004 - 8.6659 52{‘Fertilizer_4} 47.733 4.5004 10.607 52 pValue低上层e-14 63.026 92.441 0.34429 1.3108 -28.439 10.106 0.1959 -31.856 6.6895 0.0041138 9.5605 48.106 0.14858 -33.356 5.18953.3024e-07 17.303 35.364 1.1459e-11 29.969 48.031 1.308e-14 38.703 56.764随机效应协方差参数(95% CIs):组:土壤:番茄(15级)Name1 Name2类型估计{'(拦截)'}{'(拦截)'}{'std'} 10.02下上6.0812 16.509组:错误名称估计下上{'Res std'} 12.325 10.024 15.153gydF4y2Ba
比较这两个模型gydF4y2Ba比较gydF4y2Ba
方法采用模拟似然比检验,因为固定效应项和随机效应项都经过检验。gydF4y2Ba
加载样例数据。gydF4y2Ba
负载(gydF4y2Ba“weight.mat”gydF4y2Ba)gydF4y2Ba
重量gydF4y2Ba
包含一项纵向研究的数据,其中20名受试者被随机分配到4个运动项目(a、B、C、D),并记录他们在6个2周的时间段内的体重减轻情况。这是模拟数据。gydF4y2Ba
将数据存储在表中。定义gydF4y2Ba主题gydF4y2Ba
而且gydF4y2Ba程序gydF4y2Ba
作为分类变量。gydF4y2Ba
tbl = table(InitialWeight,Program,Subject,Week,y);资源描述。年代ubject = nominal(tbl.Subject); tbl.Program = nominal(tbl.Program);
拟合线性混合效应模型,其中初始权重、节目类型、周以及周和节目类型之间的相互作用是固定效应。截距和周因学科而异。gydF4y2Ba
fitlmegydF4y2Ba
使用程序A作为参考,并创建必要的虚拟变量gydF4y2Ba
[,]。由于模型已经有了一个截距,gydF4y2BafitlmegydF4y2Ba
只为程序B、C和d创建虚拟变量gydF4y2Ba“参考”gydF4y2Ba
虚拟变量的编码方法。gydF4y2Ba
这个模型对应于gydF4y2Ba
在哪里gydF4y2Ba = 1, 2,…, 120,和gydF4y2Ba = 1, 2,…, 20。gydF4y2Ba 是固定效应系数,gydF4y2Ba = 0, 1,…, 8,和gydF4y2Ba 而且gydF4y2Ba 都是随机效应。gydF4y2Ba 表示初始权值和gydF4y2Ba 表示一种程序类型的虚拟变量。例如,gydF4y2Ba 为表示程序类型b的虚拟变量,随机效应和观测误差具有如下先验分布:gydF4y2Ba
Lme = fitlme(tbl,gydF4y2Ba'y ~ InitialWeight + Program*Week + (Week|Subject)'gydF4y2Ba)gydF4y2Ba
模型信息:观测数量120固定效应系数9随机效应系数40协方差参数4公式:y ~ 1 + InitialWeight +计划*周+(1 +周|受试者)模型拟合统计量:AIC BIC LogLikelihood Deviance -22.981 13.257 24.49 -48.981固定效应系数(95% ci):名称估计SE tStat DF{'(截取)'}0.66105 0.25892 2.5531 111 {'InitialWeight'} 0.0031879 0.0013814 2.3078 111 {'Program_B'} 0.36079 0.13139 2.746 111 {'Program_C'} 0.11317 0.13132 0.86175 111 {'Program_D'} 0.1732 0.067454 2.5677 111 {'Program_B:Week'} 0.038771 0.095394 0.40644 111 {'Program_C:Week'} 0.030543 0.095394 0.32018 111 {'Program_D:Week'} 0.033114 0.095394 0.34713 111 pValue Lower Upper 0.012034 0.14798 1.1741 0.022863 0.000450670.0059252 0.0070394 0.10044 0.62113 0.80029 -0.29319 0.22666 0.39068 -0.14706 0.3734 0.011567 0.039536 0.30686 0.68521 -0.15026 0.2278 0.74944 -0.15849 0.21957 0.72915 -0.15592 0.22214随机效应协方差参数(95% CIs):组:主题(20个级别)Name1 Name2类型估计{'(截取)'}{'(截取)'}{'std'} 0.18407{'周'}{'周'}{'corr'} 0.66841{'周'}{'周'}{'std'} 0.15033上下限0.12281 0.27587 0.21076 0.88573 0.11004 0.20537组:错误名称估计下上{'Res Std'} 0.10261 0.087882 0.11981gydF4y2Ba
的gydF4y2Ba
-值0.022863和0.011567表示受试者初始体重和时间对减重量有显著影响。方案B受试者的体重减轻相对于方案a受试者的体重减轻有显著差异。随机效应的协方差参数的下限和上限不包括0,因此它们是显著的。方法还可以测试随机效应的显著性gydF4y2Ba比较gydF4y2Ba
方法。gydF4y2Ba
资源描述gydF4y2Ba
- - - - - -gydF4y2Ba输入数据gydF4y2Ba数据集gydF4y2Ba
数组gydF4y2Ba输入数据,其中包括响应变量、预测变量和分组变量,指定为表或gydF4y2Ba数据集gydF4y2Ba
数组中。预测变量可以是连续变量或分组变量(参见gydF4y2Ba分组变量gydF4y2Ba).必须为使用的变量指定模型gydF4y2Ba公式gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
数据类型:gydF4y2Ba表格gydF4y2Ba
公式gydF4y2Ba
- - - - - -gydF4y2Ba模型规格公式gydF4y2Ba'y ~ fixed + (random1|grouping1) +…+ (randomR | groupingR) 'gydF4y2Ba
模型规范的公式,指定为该形式的字符向量或字符串标量gydF4y2Ba'y ~ fixed + (random1|grouping1) +…+ (randomR | groupingR) 'gydF4y2Ba
.该公式区分大小写。有关完整描述,请参见gydF4y2Ba公式gydF4y2Ba.gydF4y2Ba
例子:gydF4y2Ba'y ~治疗+(1|块)'gydF4y2Ba
的可选逗号分隔对gydF4y2Ba名称,值gydF4y2Ba
参数。gydF4y2Ba的名字gydF4y2Ba
参数名称和gydF4y2Ba价值gydF4y2Ba
对应的值。gydF4y2Ba的名字gydF4y2Ba
必须出现在引号内。您可以以任意顺序指定多个名称和值对参数gydF4y2BaName1, Value1,…,的家gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
“CovariancePattern”、“斜”、“优化”、“fminunc”、“OptimizerOptions”,选择gydF4y2Ba
指定一个模型,其中随机效应项具有对角协方差矩阵结构,以及gydF4y2BafitlmegydF4y2Ba
使用gydF4y2BafminuncgydF4y2Ba
优化算法用自定义的优化参数变量定义gydF4y2Ba选择gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
“CovariancePattern”gydF4y2Ba
- - - - - -gydF4y2Ba协方差矩阵的模式gydF4y2Ba“FullCholesky”gydF4y2Ba
(默认)|gydF4y2Ba特征向量gydF4y2Ba| gydF4y2Ba字符串标量gydF4y2Ba| gydF4y2Ba方对称逻辑矩阵gydF4y2Ba| gydF4y2Ba字符串数组gydF4y2Ba| gydF4y2Ba字符向量或逻辑矩阵的单元阵列gydF4y2Ba随机效应的协方差矩阵的模式,指定为由逗号分隔的对组成gydF4y2Ba“CovariancePattern”gydF4y2Ba
一个字符向量,一个字符串标量,一个方形对称逻辑矩阵,一个字符串数组,或者一个字符向量或逻辑矩阵的单元格数组。gydF4y2Ba
如果有gydF4y2BaRgydF4y2Ba随机效应项,然后的值gydF4y2Ba“CovariancePattern”gydF4y2Ba
必须是字符串数组或单元格数组的长度gydF4y2BaRgydF4y2Ba,其中每个元素gydF4y2BargydF4y2Ba项相关的随机效应向量的协方差矩阵的模式gydF4y2BargydF4y2Ba随机效应项。下面是每个元素的选项。gydF4y2Ba
“FullCholesky”gydF4y2Ba |
违约。使用Cholesky参数化的全协方差矩阵。gydF4y2BafitlmegydF4y2Ba 估计协方差矩阵的所有元素。gydF4y2Ba |
“全部”gydF4y2Ba |
全协方差矩阵,使用log-Cholesky参数化。gydF4y2BafitlmegydF4y2Ba 估计协方差矩阵的所有元素。gydF4y2Ba |
“对角线”gydF4y2Ba |
对角协方差矩阵。也就是说,协方差矩阵的非对角线元素被约束为0。gydF4y2Ba
|
“各向同性”gydF4y2Ba |
方差相等的对角协方差矩阵。也就是说,协方差矩阵的非对角线元素被约束为0,对角线元素被约束为相等。例如,如果有三个具有各向同性协方差结构的随机效应项,这个协方差矩阵看起来像gydF4y2Ba
在σgydF4y2Ba2gydF4y2BabgydF4y2Ba是随机效应项的公共方差。gydF4y2Ba |
“CompSymm”gydF4y2Ba |
复合对称结构。也就是说,在所有随机效应之间,沿着对角线的共同方差和相等的相关性。例如,如果有三个随机效应项,协方差矩阵具有复合对称结构,这个协方差矩阵看起来像这样gydF4y2Ba
在σgydF4y2Ba2gydF4y2Bab1gydF4y2Ba随机效应项和σ的共同方差是多少gydF4y2Bab1、b2gydF4y2Ba是任意两个随机效应项之间的协方差。gydF4y2Ba |
帕特gydF4y2Ba |
方形对称逻辑矩阵。如果gydF4y2Ba“CovariancePattern”gydF4y2Ba 是由矩阵定义的gydF4y2Ba帕特gydF4y2Ba ,如果gydF4y2BaPAT(a,b) = falsegydF4y2Ba ,则gydF4y2Ba(a, b)gydF4y2Ba 对应协方差矩阵的元素约束为0。gydF4y2Ba |
例子:gydF4y2Ba“CovariancePattern”、“对角线”gydF4y2Ba
例子:gydF4y2BaCovariancePattern,{“完整”,“对角线”}gydF4y2Ba
数据类型:gydF4y2Ba字符gydF4y2Ba
| gydF4y2Ba字符串gydF4y2Ba
| gydF4y2Ba逻辑gydF4y2Ba
| gydF4y2Ba细胞gydF4y2Ba
“FitMethod”gydF4y2Ba
- - - - - -gydF4y2Ba参数估计方法gydF4y2Ba毫升的gydF4y2Ba
(默认)|gydF4y2Ba“REML”gydF4y2Ba
估计线性混合效应模型参数的方法,指定为逗号分隔的对,由gydF4y2Ba“FitMethod”gydF4y2Ba
或者下面的任意一种。gydF4y2Ba
毫升的gydF4y2Ba |
违约。极大似然估计gydF4y2Ba |
“REML”gydF4y2Ba |
受限极大似然估计gydF4y2Ba |
例子:gydF4y2Ba“FitMethod”、“REML”gydF4y2Ba
“重量”gydF4y2Ba
- - - - - -gydF4y2Ba观察权重gydF4y2Ba观察权重,由逗号分隔的对组成gydF4y2Ba“重量”gydF4y2Ba
和一个长度向量gydF4y2BangydF4y2Ba,在那里gydF4y2BangydF4y2Ba是观测的数量。gydF4y2Ba
数据类型:gydF4y2Ba单gydF4y2Ba
| gydF4y2Ba双gydF4y2Ba
“排除”gydF4y2Ba
- - - - - -gydF4y2Ba要排除的行的索引gydF4y2BanangydF4y2Ba
(默认)|gydF4y2Ba整数或逻辑值的向量gydF4y2Ba数据中要从线性混合效应模型中排除的行索引,指定为逗号分隔的对,由gydF4y2Ba“排除”gydF4y2Ba
和一个整数或逻辑值的向量。gydF4y2Ba
例如,您可以从拟合中排除第13行和第67行,如下所示。gydF4y2Ba
例子:gydF4y2Ba“排除”,[67]gydF4y2Ba
数据类型:gydF4y2Ba单gydF4y2Ba
| gydF4y2Ba双gydF4y2Ba
| gydF4y2Ba逻辑gydF4y2Ba
“DummyVarCoding”gydF4y2Ba
- - - - - -gydF4y2Ba用于虚拟变量的编码gydF4y2Ba“参考”gydF4y2Ba
(默认)|gydF4y2Ba“影响”gydF4y2Ba
| gydF4y2Ba“全部”gydF4y2Ba
用于从类别变量创建的虚拟变量的编码,指定为由逗号分隔的对组成gydF4y2Ba“DummyVarCoding”gydF4y2Ba
这是表格中的一个变量。gydF4y2Ba
价值gydF4y2Ba | 描述gydF4y2Ba |
---|---|
“参考”gydF4y2Ba (默认)gydF4y2Ba |
fitlmegydF4y2Ba 使用参考组创建虚拟变量。该方案将第一个类别作为参考组,创建的虚拟变量比类别数量少一个。类来检查类别变量的类别顺序gydF4y2Ba类别gydF4y2Ba 函数,并使用gydF4y2BareordercatsgydF4y2Ba 函数。gydF4y2Ba |
“影响”gydF4y2Ba |
fitlmegydF4y2Ba 使用效果编码创建虚拟变量。该方案使用-1表示最后一个类别。该方案创建的虚拟变量比类别的数量少一个。gydF4y2Ba |
“全部”gydF4y2Ba |
fitlmegydF4y2Ba 创建完整的虚拟变量。该方案为每个类别创建一个虚拟变量。gydF4y2Ba |
有关创建虚拟变量的详细信息,请参见gydF4y2Ba自动创建虚拟变量gydF4y2Ba.gydF4y2Ba
例子:gydF4y2Ba“DummyVarCoding”、“影响”gydF4y2Ba
“优化”gydF4y2Ba
- - - - - -gydF4y2Ba优化算法gydF4y2Ba“quasinewton”gydF4y2Ba
(默认)|gydF4y2Ba“fminunc”gydF4y2Ba
优化算法,指定为由逗号分隔的对组成gydF4y2Ba“优化”gydF4y2Ba
或者下面的任意一种。gydF4y2Ba
“quasinewton”gydF4y2Ba |
违约。使用一个基于信任域的准牛顿优化器。使用更改算法的选项gydF4y2Bastatset(“LinearMixedModel”)gydF4y2Ba .如果您不指定选项,那么gydF4y2BaLinearMixedModelgydF4y2Ba 的默认选项gydF4y2Bastatset(“LinearMixedModel”)gydF4y2Ba .gydF4y2Ba |
“fminunc”gydF4y2Ba |
必须使用优化工具箱™来指定此选项。使用更改算法的选项gydF4y2Baoptimoptions(“fminunc”)gydF4y2Ba .如果您不指定选项,那么gydF4y2BaLinearMixedModelgydF4y2Ba 的默认选项gydF4y2Baoptimoptions(“fminunc”)gydF4y2Ba 与gydF4y2Ba“算法”gydF4y2Ba 设置为gydF4y2Ba“拟牛顿”gydF4y2Ba .gydF4y2Ba |
例子:gydF4y2Ba“优化”、“fminunc”gydF4y2Ba
“OptimizerOptions”gydF4y2Ba
- - - - - -gydF4y2Ba优化算法选项gydF4y2BastatsetgydF4y2Ba
| gydF4y2Ba返回的对象gydF4y2BaoptimoptionsgydF4y2Ba
优化算法的选项,指定为由逗号分隔的对组成gydF4y2Ba“OptimizerOptions”gydF4y2Ba
和返回的结构gydF4y2Bastatset(“LinearMixedModel”)gydF4y2Ba
或返回的对象gydF4y2Baoptimoptions(“fminunc”)gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
如果gydF4y2Ba“优化”gydF4y2Ba
是gydF4y2Ba“fminunc”gydF4y2Ba
,然后使用gydF4y2Baoptimoptions(“fminunc”)gydF4y2Ba
修改优化算法选项。看到gydF4y2BaoptimoptionsgydF4y2Ba
对于选项gydF4y2Ba“fminunc”gydF4y2Ba
用途。如果gydF4y2Ba“优化”gydF4y2Ba
是gydF4y2Ba“fminunc”gydF4y2Ba
你不供应gydF4y2Ba“OptimizerOptions”gydF4y2Ba
,则默认为gydF4y2BaLinearMixedModelgydF4y2Ba
默认选项是由gydF4y2Baoptimoptions(“fminunc”)gydF4y2Ba
与gydF4y2Ba“算法”gydF4y2Ba
设置为gydF4y2Ba“拟牛顿”gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
如果gydF4y2Ba“优化”gydF4y2Ba
是gydF4y2Ba“quasinewton”gydF4y2Ba
,然后使用gydF4y2Bastatset(“LinearMixedModel”)gydF4y2Ba
修改优化参数。如果你不改变优化参数,那么gydF4y2BaLinearMixedModelgydF4y2Ba
创建的默认选项gydF4y2Bastatset(“LinearMixedModel”)gydF4y2Ba
:gydF4y2Ba
的gydF4y2Ba“quasinewton”gydF4y2Ba
优化器在创建的结构中使用以下字段gydF4y2Bastatset(“LinearMixedModel”)gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
TolFungydF4y2Ba
-目标函数梯度的相对公差gydF4y2Ba1 e-6gydF4y2Ba
(默认)|正标量值gydF4y2Ba目标函数梯度上的相对公差,指定为正标量值。gydF4y2Ba
TolXgydF4y2Ba
-步长绝对公差gydF4y2Ba1 e-12gydF4y2Ba
(默认)|正标量值gydF4y2Ba步长上的绝对公差,指定为正标量值。gydF4y2Ba
麦克斯特gydF4y2Ba
-允许的最大迭代次数gydF4y2Ba10000gydF4y2Ba
(默认)|正标量值gydF4y2Ba允许的最大迭代次数,指定为正标量值。gydF4y2Ba
显示gydF4y2Ba
-显示水平gydF4y2Ba“关闭”gydF4y2Ba
(默认)|gydF4y2Ba“通路”gydF4y2Ba
| gydF4y2Ba“最后一次”gydF4y2Ba
显示级别,指定为之一gydF4y2Ba“关闭”gydF4y2Ba
,gydF4y2Ba“通路”gydF4y2Ba
,或gydF4y2Ba“最后一次”gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
“StartMethod”gydF4y2Ba
- - - - - -gydF4y2Ba方法启动迭代优化gydF4y2Ba“默认”gydF4y2Ba
(默认)|gydF4y2Ba“随机”gydF4y2Ba
方法启动迭代优化,指定为由逗号分隔的对组成gydF4y2Ba“StartMethod”gydF4y2Ba
或者下面的任意一种。gydF4y2Ba
价值gydF4y2Ba | 描述gydF4y2Ba |
---|---|
“默认”gydF4y2Ba |
内部定义的默认值gydF4y2Ba |
“随机”gydF4y2Ba |
一个随机的初始值gydF4y2Ba |
例子:gydF4y2Ba“StartMethod”、“随机”gydF4y2Ba
“详细”gydF4y2Ba
- - - - - -gydF4y2Ba在屏幕上显示优化过程的指示器gydF4y2Ba假gydF4y2Ba
(默认)|gydF4y2Ba真正的gydF4y2Ba
指示器在屏幕上显示优化过程,指定为由逗号分隔的对组成gydF4y2Ba“详细”gydF4y2Ba
,要么gydF4y2Ba假gydF4y2Ba
或gydF4y2Ba真正的gydF4y2Ba
.默认是gydF4y2Ba假gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
的设置gydF4y2Ba“详细”gydF4y2Ba
覆盖字段gydF4y2Ba“显示”gydF4y2Ba
在gydF4y2Ba“OptimizerOptions”gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
例子:gydF4y2Ba“详细”,真的gydF4y2Ba
“CheckHessian”gydF4y2Ba
- - - - - -gydF4y2Ba黑森钢阳性确定度检查指标gydF4y2Ba假gydF4y2Ba
(默认)|gydF4y2Ba真正的gydF4y2Ba
用于检查目标函数的Hessian在收敛时相对于无约束参数的正确定性的指示器,指定为逗号分隔的对,由gydF4y2Ba“CheckHessian”gydF4y2Ba
,要么gydF4y2Ba假gydF4y2Ba
或gydF4y2Ba真正的gydF4y2Ba
.默认是gydF4y2Ba假gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
指定gydF4y2Ba“CheckHessian”gydF4y2Ba
作为gydF4y2Ba真正的gydF4y2Ba
验证解决方案的最优性或确定模型是否在协方差参数的数量上过度参数化。gydF4y2Ba
例子:gydF4y2Ba“CheckHessian”,真的gydF4y2Ba
lme三个月gydF4y2Ba
-线性混合效应模型gydF4y2BaLinearMixedModelgydF4y2Ba
对象gydF4y2Ba线性混合效果模型,返回为gydF4y2BaLinearMixedModelgydF4y2Ba
对象。gydF4y2Ba
通常,模型规范的公式是这种形式的字符向量或字符串标量gydF4y2Ba“y ~项”gydF4y2Ba
.对于线性混合效应模型,公式为gydF4y2Ba'y ~ fixed + (random1|grouping1) +…+ (randomR | groupingR) 'gydF4y2Ba
,在那里gydF4y2Ba固定gydF4y2Ba
而且gydF4y2Ba随机gydF4y2Ba
包含固定效应和随机效应术语。gydF4y2Ba
假设有一张桌子gydF4y2Ba资源描述gydF4y2Ba
包含以下内容:gydF4y2Ba
一个响应变量,gydF4y2BaygydF4y2Ba
预测变量,gydF4y2BaXgydF4y2BajgydF4y2Ba
,可以是连续变量,也可以是分组变量gydF4y2Ba
分组变量,gydF4y2BaggydF4y2Ba1gydF4y2Ba
,gydF4y2BaggydF4y2Ba2gydF4y2Ba
、……gydF4y2BaggydF4y2BaRgydF4y2Ba
,gydF4y2Ba
分组变量在哪里gydF4y2BaXgydF4y2BajgydF4y2Ba
而且gydF4y2BaggydF4y2BargydF4y2Ba
可以是分类的、逻辑的、字符数组、字符串数组或字符向量的单元格数组。gydF4y2Ba
然后,在这样的公式中,gydF4y2Ba'y ~固定+(随机gydF4y2Ba1gydF4y2Ba| ggydF4y2Ba1gydF4y2Ba) +…+(随机gydF4y2BaRgydF4y2Ba| ggydF4y2BaRgydF4y2Ba)”gydF4y2Ba
,术语gydF4y2Ba固定gydF4y2Ba
对应于固定效果设计矩阵的规范gydF4y2BaXgydF4y2Ba
,gydF4y2Ba随机gydF4y2Ba
1gydF4y2Ba是随机效应设计矩阵的规范吗gydF4y2BaZgydF4y2Ba
1gydF4y2Ba对应于分组变量gydF4y2BaggydF4y2Ba
1gydF4y2Ba,类似地gydF4y2Ba随机gydF4y2Ba
RgydF4y2Ba是随机效应设计矩阵的规范吗gydF4y2BaZgydF4y2Ba
RgydF4y2Ba对应于分组变量gydF4y2BaggydF4y2Ba
RgydF4y2Ba.你可以表达gydF4y2Ba固定gydF4y2Ba
而且gydF4y2Ba随机gydF4y2Ba
使用威尔金森符号的术语。gydF4y2Ba
威尔金森符号描述了模型中存在的因素。符号与模型中存在的因子有关,而不是那些因子的乘数(系数)。gydF4y2Ba
威尔金森符号gydF4y2Ba | 标准符号中的因素gydF4y2Ba |
---|---|
1gydF4y2Ba |
常数(截距)项gydF4y2Ba |
X ^ kgydF4y2Ba ,在那里gydF4y2BakgydF4y2Ba 是正整数gydF4y2Ba |
XgydF4y2Ba ,gydF4y2BaXgydF4y2Ba2gydF4y2Ba 、……gydF4y2BaXgydF4y2BakgydF4y2Ba |
X1 + x2gydF4y2Ba |
X1gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX2gydF4y2Ba |
X1 * X2gydF4y2Ba |
X1gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX2gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX1。* X2(elementwise multiplication of X1 and X2) |
X1, X2gydF4y2Ba |
X1。* X2gydF4y2Ba 只有gydF4y2Ba |
- - - - - - X2gydF4y2Ba |
不包括gydF4y2BaX2gydF4y2Ba |
X1* x2 + x3gydF4y2Ba |
X1gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX2gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX3gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX1 * X2gydF4y2Ba |
X1 + x2 + x3 + X1 = x2gydF4y2Ba |
X1gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX2gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX3gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX1 * X2gydF4y2Ba |
X1* x2 * x3 - X1: x2: x3gydF4y2Ba |
X1gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX2gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX3gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX1 * X2gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX1 * X3gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX2 * X3gydF4y2Ba |
X1*(x2 + x3)gydF4y2Ba |
X1gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX2gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX3gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX1 * X2gydF4y2Ba ,gydF4y2BaX1 * X3gydF4y2Ba |
统计和机器学习工具箱™符号总是包含一个常数项,除非您显式地使用删除该术语gydF4y2Ba-1gydF4y2Ba
.以下是线性混合效应模型规范的一些示例。gydF4y2Ba
例子:gydF4y2Ba
公式gydF4y2Ba | 描述gydF4y2Ba |
---|---|
'y ~ X1 + X2'gydF4y2Ba |
固定效果的拦截,gydF4y2BaX1gydF4y2Ba 而且gydF4y2BaX2gydF4y2Ba .这相当于gydF4y2Ba'y ~ 1 + X1 + X2'gydF4y2Ba .gydF4y2Ba |
'y ~ -1 + X1 + X2'gydF4y2Ba |
无拦截和固定效果gydF4y2BaX1gydF4y2Ba 而且gydF4y2BaX2gydF4y2Ba .隐式截距项通过包含来抑制gydF4y2Ba-1gydF4y2Ba .gydF4y2Ba |
'y ~ 1 + (1 | g1)'gydF4y2Ba |
固定效果的拦截加上随机效果的拦截为每个级别的分组变量gydF4y2Bag1gydF4y2Ba .gydF4y2Ba |
'y ~ X1 + (1 | g1)'gydF4y2Ba |
斜率固定的随机截距模型。gydF4y2Ba |
'y ~ X1 + (X1 | g1)'gydF4y2Ba |
随机截距和斜率,两者之间可能存在相关性。这相当于gydF4y2Ba'y ~ 1 + X1 + (1 + X1|g1)'gydF4y2Ba .gydF4y2Ba |
'y ~ X1 + (1 | g1) + (-1 + X1 | g1)'gydF4y2Ba |
截距和斜率的独立随机效应项。gydF4y2Ba |
'y ~ 1 + (1 | g1) + (1 | g2) + (1 | g1:g2)'gydF4y2Ba |
具有独立主效应的随机截距模型gydF4y2Bag1gydF4y2Ba 而且gydF4y2Bag2gydF4y2Ba ,加上独立的相互作用效应。gydF4y2Ba |
线性混合效应模型的一个假设是随机效应具有如下先验分布。gydF4y2Ba
在哪里gydF4y2BaDgydF4y2Ba是一个gydF4y2Ba问gydF4y2Ba——- - - - - -gydF4y2Ba问gydF4y2Ba对称正半定矩阵,由方差分量向量参数化gydF4y2BaθgydF4y2Ba,gydF4y2Ba问gydF4y2Ba变量的数量是随机效应项,和gydF4y2BaσgydF4y2Ba2gydF4y2Ba是观测误差方差。由于随机效应的协方差矩阵,gydF4y2BaDgydF4y2Ba是对称的,它有gydF4y2Ba问gydF4y2Ba(gydF4y2Ba问gydF4y2Ba+1)/2个自由参数。假设gydF4y2BalgydF4y2Ba下三角Cholesky因子是多少gydF4y2BaDgydF4y2Ba(gydF4y2BaθgydF4y2Ba)如此gydF4y2Ba
然后gydF4y2Ba问gydF4y2Ba*(gydF4y2Ba问gydF4y2Ba+1)/2 × 1无约束参数向量gydF4y2BaθgydF4y2Ba是由下三角形部分的元素构成的吗gydF4y2BalgydF4y2Ba.gydF4y2Ba
例如,如果gydF4y2Ba
然后gydF4y2Ba
当对角线元素gydF4y2BalgydF4y2Ba在Cholesky参数化条件下约束为正,则解为gydF4y2BalgydF4y2Ba是独一无二的。Log-Cholesky参数化和Cholesky参数化是一样的,除了对角线元素的对数gydF4y2BalgydF4y2Ba用于保证唯一的参数化。gydF4y2Ba
例如,对于Cholesky参数化中的3 × 3示例,强制gydF4y2BalgydF4y2Ba2gydF4y2Ba≥0,gydF4y2Ba
如果您的模型不容易用公式描述,您可以创建矩阵来定义固定和随机效应,并使用拟合模型gydF4y2Bafitlmematrix (X, y, Z, G)gydF4y2Ba
.gydF4y2Ba
j·C·皮涅里奥和d·m·贝茨。方差-协方差矩阵的无约束参数化。gydF4y2Ba统计与计算gydF4y2Ba, Vol. 6, 1996, pp. 289-296。gydF4y2Ba
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