主要内容

剩余物

班级:LinearMixedModel

拟合线性混合效应模型的残留物

描述

例子

R=残差(LME.从拟合的线性混合效果模型返回原始条件残留物LME.

例子

R=残差(LME.名称,价值返回线性混合效应模型的残差LME.具有一个或多个指定的其他选项名称,价值对论点。

例如,您可以指定皮尔逊或标准化残差,或仅来自固定效应的残差。

输入参数

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线性混合效果模型,指定为aLinearMixedModel使用的对象fitlme.或者fitlmematrix.

名称-值参数

指定可选的逗号分隔的对名称,价值论点。的名字参数名和价值是相应的价值。的名字必须出现在引号内。您可以以任何顺序指定多个名称和值对参数name1,value1,...,namen,valuen

条件剩余的指示符,指定为逗号分隔对,由“条件”下面是其中之一。

真的 固定效应和随机效应的贡献(条件)
错误的 只有固定效果的贡献(边缘)

例子:“条件”,假的

由逗号分隔对指定的剩余类型ResidualType下面是其中之一。

剩余的类型 条件 边际
'生的'

r C y X β Z b

r y X β

'Pearson'

p r C r C V 一个 r y b y X β Z b

p r r V 一个 r y y X β

'标准化'

年代 t C r C V 一个 r y r C

年代 t r V 一个 r y r

有关条件残差和边际残差及残差方差的更多信息,请参阅定义在本页结尾。

例子:'Residualtype','标准化'

输出参数

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拟合线性混合效应模型的残留物LME.作为一个返回n-by-1矢量,在哪里n是观察人数。

例子

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加载样本数据。

负载(“weight.mat”);

重量包含纵向研究的数据,20名受试者被随机分配到4个运动项目,他们的减肥记录超过6个2周的时间周期。这是模拟数据。

将数据存储在表中。定义主题程序作为分类变量。

台=表(InitialWeight、程序、主题周,y);资源描述。主题=名义(tbl.Subject);资源描述。程序=名义(tbl.Program);

适合线性混合效应模型,其中初始重量,程序类型,周和计划之间的互动以及程序类型是固定效果。拦截和周因主题而异。

lme = fitlme(资源描述,'Y〜初始重量+计划*周+(周|主题)');

计算拟合值和原始残留物。

f =安装(LME);r =残差(LME);

绘制残差与拟合值的关系。

情节(F R'bx')Xlabel(的拟合值)ylabel('残留'

图中包含一个轴对象。axis对象包含一个类型为line的对象。

现在,把残差和拟合值绘制出来,按程序分组。

图();gscatter (F R程序)

图中包含一个轴对象。轴对象包含4个类型为line的对象。这些对象代表A, B, C, D。

随着预期的计划,残差似乎表现出类似的程序。

加载样本数据。

负载carbig

将每加仑英里(MPG)、加速、马力、汽缸和车型年的变量存储在一个表格中。

台=表(MPG、加速度、马力、汽缸Model_Year);

拟合每加仑英里数(MPG)的线性混合效应模型,其中加速度、马力和汽缸的影响是固定的,按模型年份分组的截距和加速度的潜在随机效应是相关的。

lme = fitlme(资源描述,'MPG ~加速度+马力+气缸+(加速度|Model_Year)');

计算条件皮尔逊残差并显示前5个残差。

公关=残差(lme,'Residualtype''Pearson');PR(1:5)
ANS =.5×1-0.0533 0.0652 0.3655 -0.0106 0.3340

计算边际皮尔森残差并显示前5个残差。

PRM =残留物(LME,'Residualtype''Pearson'“条件”,错误的);PRM(1:5)
ANS =.5×1-0.1250 0.0130 0.3242 -0.0861-0.3006

加载样本数据。

负载carbig

将每加仑英里(MPG)、加速、马力、汽缸和车型年的变量存储在一个表格中。

台=表(MPG、加速度、马力、汽缸Model_Year);

拟合每加仑英里数(MPG)的线性混合效应模型,其中加速度、马力和汽缸的影响是固定的,按模型年份分组的截距和加速度的潜在随机效应是相关的。

lme = fitlme(资源描述,'MPG ~加速度+马力+气缸+(加速度|Model_Year)');

用正常合身绘制原始残留的直方图。

r =残差(lme);histfit(右)

图中包含一个轴对象。axis对象包含两个类型为bar, line的对象。

正态分布似乎很适合残差。

计算条件皮尔森残差和标准化残差,并创建所有三种残差的箱形图。

公关=残差(lme,'Residualtype''Pearson');st =残差(LME,'Residualtype''标准化');X = [r pr st];箱线图(X)

图中包含一个轴对象。axis对象包含21个类型为line的对象。

Red Plus标志显示与高于或更低的残差的观察结果 3. + 1 5 3. - 1 1 - 1 5 3. - 1 , 在哪里 1 3. 分别是第25和75个百分位数。

找出残差在平均值上下为2.5个标准差的观测值。

找到(r >的意思是(r,“omitnan”)+ 2.5 * std(r,“omitnan”))
ANS =.7×162 252 255 330 337 341 396
查找(R <均值(r,“omitnan”) - 2.5 *性病(r,“omitnan”))
ANS =.3×1119 324 375.

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