goannotread

阅读从基因本体论注释文件注释

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句法

注解= goannotread（文件）注解= goannotread（文件......“字段”，FieldsValue，...）注解= goannotread（文件......“看点”，AspectValue，...）

文件

字符向量或字符串指定基因本体论（GO）注释格式（GAF）文件的文件名。

FieldsValue

字符向量、字符串、字符串向量或字符向量的单元数组，这些字符向量指定要从基因本体注释文件读取的一个或多个字段。默认是读取所有字段。下面列出了有效字段。

AspectValue

字符向量或字符串，指定一个或多个字符。有效的方面是：

默认值是'CFP'，指定阅读的各个方面。

注解 MATLAB^®包含来自基因本体论注释结构阵列的注释的文件。

该goannotread功能支持GAF 1万博1manbetx.0和2.0的文件格式。

注解= goannotread（文件）转换的内容文件，一个基因本体论注释的文件，到注解，结构的阵列。文件应该由基因本体协会指定的结构，可在：

http://www.geneontology.org/

注解= goannotread（文件，...”属性名”，适当的价值，...）电话goannotread部分可选的属性是使用属性名称/属性值对。您可以按任意顺序指定一个或多个属性。每属性名必须用单引号和不区分大小写。这些属性名称/属性值对如下：

注解= goannotread（文件......“字段”，FieldsValue，...）指定的字段从基因本体注释文件中读取。FieldsValue是一个字符向量，字符串，字符串矢量，或字符向量指定一个或多个字段的单元阵列。默认是读取所有字段。有效的字段有：

注解= goannotread（文件......“看点”，AspectValue，...）指定的各个方面，从基因本体注释文件中读取。AspectValue是指定一个或多个字符的向量或字符串。有效的方面是：

默认值是'CFP'，指定阅读的各个方面。

下载gene_association.sgd.gz包含文件走注解的基因产物s manbetx 845酿酒酵母从酵母基因组网站你的MATLAB当前文件夹。
解压缩使用的文件gunzip解功能。
```
gunzip解（'gene_association.sgd.gz'）
```

加载该文件。

SGDGenes = goannotread（'gene_association.sgd'）;

创建一个结构走注释和显示的第一个五年基因列表。

S = struct2cell（SGDGenes）;基因= S（3,1：5）”

基因= '15S_RRNA' '15S_RRNA' '15S_RRNA' '15S_RRNA' '21S_RRNA'

您可以限制注释相关的分子功能的基因（F)和基因符号和相关ID的字段，也就是，DB_Object_Symbol和GOID。

sgdSelect = goannotread（'gene_association.sgd'，'方面'，'F'，“字段”{'DB_Object_Symbol'，'GOID'}）

sgdSelect = 30701×1结构数组，字段:DB_Object_Symbol GOid

创建基因和相关的GO术语的列表。

selectGenes = {sgdSelect.DB_Object_Symbol};selectGO = [sgdSelect.GOid];