mapcaplot
创建主成分分析(PCA)的微阵列数据
描述
例子
创建PCA的微阵列数据
创建一个PCA阴谋可视化基因在酵母的代谢从发酵转移到呼吸(酿酒酵母)。
加载数据文件,其中包含过滤酵母微阵列数据。数据来自一个实验(DeRisi et al ., 1997),使用DNA微阵列研究时序基因表达的基因。表达水平测量时间点7点在diauxic转变。
负载filteredyeastdata
这个MAT-file包括三个变量:
yeastvalues——从酿酒酵母基因表达数据的矩阵(酵母)发酵的代谢转变期间呼吸
基因——一个单元阵列的基因库®加入数字标签yeastvalues中的行
次——一个向量的时间在yeastvalues标识列的值
对表达式进行主成分分析数据和阴谋的结果。
mapcaplot (yeastvalues,基因)
选择一个子集的数据点通过拖放一个盒子。数据点及其对应的标签出现在突出显示选定的数据。然后您可以导出所选数据选择工作区出口。
输入参数
引用
[1]DeRisi J.L.艾耶,稳压器,和Brown, P.O. (1997). Exploring the metabolic and genetic control of gene expression on a genomic scale. Science 278, 680–686s.
