生物信息学工具箱软件支持包万博1manbetx

生物信息工具箱™提供了各种下一代测序工作流程和分析支持包。万博1manbetx为了提供一个支持包在万博1manbetx你的MATLAB®命令行，必须先安装它。

安装支持包万博1manbetx

请按照以下步骤安装支持包。万博1manbetx

  1. 在里面环境MATLAB的工具条的部分，选择加载项>获取附加组件。

  2. 在加载在浏览器，搜索您想要输入其名称安装支持包。万博1manbetx

  3. 安装支持包。万博1manbetx

有关安装的加载项的详细信息，请参阅获取和管理加载项。对于其他信息，请参阅加载项。

可支持包万博1manbetx

下表列出了所有的生物信息工具箱支持包可供下载的插件。万博1manbetx

万博1manbetx支持包名称

版†

通讯功能的MATLAB

 万博1manbetx支持的操作系统

生物信息学工具箱界面领结定位仪[1]

2.3.2

bowtie2，bowtie2build，bowtie2inspect。

苹果电脑和UNIX®

袖扣支持包的生物信息万博1manbetx工具箱[2]

2.2.1

袖扣，cuffcompare，cuffdiff，cuffgffread，cuffgtf2sam，cuffmerge，cuffnorm，cuffquant。

苹果电脑和UNIX

BWA 万博1manbetxSupport Package的生物信息工具箱[4][5]

0.7.17

bwaindex，bwamem。

苹果电脑和UNIX

†原来的版本（第三方）软件

相关话题

参考

[1]Langmead，本，和史蒂芬大号Salzberg。“快跳空读对准领结2”。自然方法9，没有。4（2012年4月）：357-59。https://doi.org/10.1038/nmeth.1923。

[2]Trapnell，科尔，布赖恩·威廉姆斯，地理Pertea，阿里Mortazavi，戈登关，MarijkeĴ面包车巴伦，史蒂芬大号Salzberg，芭芭拉Ĵ沃尔德和利尔·帕特。“转录物装配和定量通过RNA-SEQ揭示未注解的转录和亚型细胞分化期间切换”。自然生物技术28，没有。5（2010年5月）：511-15。

[3]Mortazavi，阿里，布赖恩·威廉姆斯，肯尼斯·麦丘，Lorian谢弗，和芭芭拉尔德。“映射和量化哺乳动物转录由RNA-SEQ”。自然方法5，没有。7（2008年7月）：621-28。https://doi.org/10.1038/nmeth.1226。

[4]李衡，和杜宾。“变换的快速和精准的长读对准巴路士惠勒。”生物信息学26，没有。5（2010年3月1日）：589-95。https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp698。

[5]李衡，和杜宾。“转换快速，准确的短读对齐巴路士惠勒。”生物信息学25，没有。14（2009年7月15日）：1754年至1760年。https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp324。

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