核苷酸序列分析
计算和交互式探索序列统计;计算序列属性;分析主题;设计引物;寻找限制性内切酶
应用程序
| 顺序查看器 | 可视化和交互式探索生物序列 |
功能
basecount |
按顺序计数核苷酸 |
codonbias |
计算核苷酸序列中编码的每个氨基酸的密码子频率 |
codoncount |
计数核苷酸序列中的密码子 |
dimercount |
计算核苷酸序列中的二聚体 |
ntdensity |
沿序列绘制核苷酸密度图 |
seqwordcount |
按顺序计算单词出现的次数 |
nt2aa |
将核苷酸序列转换为氨基酸序列 |
aa2nt |
将氨基酸序列转化为核苷酸序列 |
nt2int |
将核苷酸序列从字母转换为整数表示 |
int2nt |
将核苷酸序列从整数转换为字母表示 |
dna2rna |
将DNA序列转化为RNA序列 |
rna2dna |
将RNA序列转化为DNA序列 |
revgeneticcode |
返回遗传密码的反向映射(氨基酸到核苷酸密码子) |
seqcomplement |
计算核苷酸序列的互补链 |
seqrcomplement |
计算核苷酸序列的反向互补链 |
seqreverse |
计算核苷酸序列的反链 |
baselookup |
查找核苷酸编码、整数、名称和补体 |
geneticcode |
返回核苷酸密码子到氨基酸映射的遗传密码 |
oligoprop |
计算DNA寡核苷酸的序列性质 |
cpgisland |
在DNA序列中定位CpG岛 |
joinseq |
连接两个序列以生成最短的超序列 |
回文 |
按顺序找到回文 |
randseq |
从有限字母生成随机序列 |
seqmatch |
查找匹配库中的每个字符向量 |
seqviewer |
可视化和交互式探索生物序列 |
seqdisp |
格式长序列输出，便于查看 |
seqshoworfs |
按顺序显示打开的阅读帧 |
featureparse |
从基因库、GenPept或EMBL数据 |
featureview |
绘制线性或圆形的特征图基因库结构 |
seqconsensus |
计算共识序列 |
seqdotplot |
创建两个序列的点图 |
seqlogo |
显示核苷酸或氨基酸序列的序列标识 |
seqprofile |
从一组多重对齐的序列中计算序列剖面 |
seqinsertgaps |
在核苷酸或氨基酸序列中插入间隙 |
rebasecuts |
找到切断核苷酸序列的限制性内切酶 |
限制 |
限制位点核苷酸序列分裂 |
seq2regexp |
将具有模糊字符的序列转换为正则表达式 |
主题
从DNA序列开始，计算核苷酸含量的统计数据。
序列函数使用图形界面。
您可以操作和分析序列，以更深入地了解数据的物理、化学和生物特征。
特色的例子
您也可以从以下列表中选择一个网站:
