罗兰关于MATLAB的艺术

将想法转化为MATLAB

重现性思考——嘿,再做一次!

今天我有一个来自丽莎KemplerMathWorks的MATLAB社区策略师。Lisa在诸如地球物理学、海洋学、听力学等领域与MATLAB社区合作,帮助用户开发基于MATLAB的工具,并为MATLAB的教学和研究创建资源。一个主要目标是让MATLAB用户在他们的社区内更广泛地分享他们的工具和最佳实践,提高他们对MATLAB的使用,进而加快他们的工作。本博客讨论了一些支持共享目标的研究工作。万博1manbetx

内容

再现性是什么?

关于可再生研究的话题有很多议论。支持者和研究人员都将受到新的可重复性预期的影响,他们提出了很多问题,关于

  • 定义和范围:
-简单地说,可重复研究是什么意思?-它包含什么-数据?软件吗?硬件?实验和现场物理环境设置?
  • 指导和监督:
-谁来制定标准?-如何执行?
  • 有效性和实用性:
-科学家将如何资助额外的时间和资源来遵守新的要求?-真的会有人用这些新机器来重现研究成果吗?多长时间?足够让你觉得值得吗?

在最基本的层面上,可重复研究的想法是,未来有人想要重现你的研究成果,就可以。其理论是,可再现性将使对已发表研究的更全面的理解和使用,使未来的研究人员能够重用和复制前人的工作将更有效,避免重复发明轮子,并为我们所有人节省集体时间来解决问题。万博 尤文图斯从表面上看,这样一个实际的目标似乎是可取的。然而,这种一阶影响并不是组织推动再现性的唯一驱动力。

为什么它很重要?

重现性运动的首要目标是渴望可靠的研究。换句话说,研究赞助商和消费者想知道报告的研究结果是准确的,并且是经过验证的。通过创建和执行新的研究,并围绕可再现性发表最佳实践,资助组织,如IEEE, NIH和NSF,正在寻求显著减少未来的撤回,包括由剽窃造成的。我们希望,如果那些提交论文发表的人被要求使他们的研究投入、方法和输出更透明,那么研究结果必然会更可靠。该理论认为,更可靠的结论反过来会导致更少的撤回。作为额外的好处,这个可重复的研究可以被其他研究人员重复使用。

这看起来像是为了避免撤回而做了很多工作。一个令人震惊的事实是,每年都有成百上千的撤回。一个2014文章在phys.org报告在他们的档案中发现了16篇实际上是电脑生成的文章;是的,它们是由机器制造的,而不是人类。随后,IEEE在他们的档案中又找到了100多个。

就可重复的研究需求和方法达成共识

各种组织举行了关于再现性的会议,目的是就最佳做法和下一步步骤达成一些共识。MathWorks的代表参与了其中的多个项目。例如,布朗大学的ICERM举办了一个研讨会-计算和实验数学中的再现性-早在2012年,罗兰就参加了。去年12月,有一个专门讨论可持续软件的会议在美国地球物理联盟秋季会议上,我发表了演讲。已经就相关话题举行了多次其他讨论,还有更多的讨论即将进行;这对许多玩家来说是一个大胆的尝试,更不用说任何解决方案都需要可访问和可用的网络基础设施,以获得目标用户群体的支持和使用。

个人研究人员的努力和MATLAB相关工具和能力

与此同时,一些研究人员正在自己努力,使他们的研究具有可重复性,同时对读者和其他消费者更加透明。三一学院和麻省理工学院生物力学媒体实验室的凯文·莫尔曼就是这样一位研究人员。在2015年9月的一篇博文中,他描述了学术界的挑战,正是这些挑战促使他将MATLAB与开放科学结合起来。在他的帖子中,他基本上是在记录一份菜谱其他研究人员可以分享代码,使他们的工作更加透明。

一个MATLAB特性使Kevin能够使工具箱更容易访问GitHub凝视.也就是说凯文把工具箱贡献给了MATLAB文件交换并将下载源设置为GitHub,这样他就可以用一组源代码提供工具箱的两个入口点。

在他的帖子中,凯文得出结论,发展吉本工具箱而且免费提供对他的职业生涯来说是一个巨大的推动。根据Kevin的说法,“发布GIBBON开源使我的工作在国际层面上的影响最大化”。

轮到你

你如何让你的研究成果在你的社区可用?让我们知道在这里

凯文Moerman的从属关系

1.都柏林大学圣三一生物工程中心,圣三一学院,都柏林,爱尔兰

2.生物,媒体实验室。,Massachusetts Institute of Technology, Cambridge MA, USA




发布与MATLAB®R2015b

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